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别人处理二代测序的流程

来源:互联网 
 做了基因组研究的summary,请各位大老帮忙看看,GCE评估180M(二倍体),杂合率为0.0119/21kmer,用ALLPATH-LG的 ErrorCorrectReads.pl进行评估83M(单倍体),SNP率1/48,接着用canu进行组装,组装出165M的基因组,(1)直接进行FinisherSC和pilon进行升级,得150M基因组,用二代reads进行回帖,99.2%的回帖率,BUSCO 96.9%的完整率。  做了基因组研究的summary,请各位大老帮忙看看,GCE评估180M(二倍体),杂



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